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外泌體是由細胞分泌的納米級膜性小囊泡,直徑約30~150nm。外泌體來源多樣,廣泛存在并分布于各種生物液體中,富含來源細胞的蛋白質、脂質和核酸,參與細胞間的信息交流。不同病理和生理條件下,外泌體的內容物不盡相同,因此外泌體可以很好地反映生物體的疾病與健康狀態(tài)。此外,外泌體特殊的膜結構能夠保護其內容物如RNA(microRNA、mRNA、lncRNA、circRNA)免受酶的降解,保證其能在各類體液中被穩(wěn)定檢測到,因此外泌體是研究各種疾病的良好生物學材料,可作為腫瘤潛在的biomarker和治療靶點,亦可作為基因/藥物的遞送載體,在疾病的診斷和治療方面具有廣闊的應用前景。
據(jù)統(tǒng)計,2019年國自然中標的外泌體相關項目總計600多項,總金額高達2.5億,相較2018年,總金額增長了44.5%,足可見外泌體研究的火熱程度。近幾年,隨著高通量檢測技術的飛速發(fā)展,對外泌體進行組學研究極大地推動了外泌體的研究進展。伯豪生物致力于科研服務,擁有高標準的樣品處理平臺、微陣列芯片平臺、高通量測序平臺、生物標志物平臺、生物信息分析平臺等多個平臺,能夠實現(xiàn)外泌體分離、鑒定、內含物(蛋白質、mRNA、ncRNA)檢測及驗證的“一站式”外泌體研究服務。
那么如何開展外泌體研究,第一步也是相當重要的一步就是收集外泌體含量高的樣本。外泌體存在于各種生物體液中,如血液、乳汁、尿液,腦脊液,那么如何有效的收集各種類型的樣本用于后續(xù)的外泌體分離呢,下面我們來簡單介紹下各類型外泌體樣本的具體收集方法。
注意:收集血清樣本時一定不能加入抗凝劑。
1) 采集外周血(建議早晨空腹抽血),迅速轉入不含EDTA的試管中;
2) 室溫(22℃~25℃)下靜置30分鐘,或4℃下靜置3~4小時,可見自行凝固;
3) 吸取上清至新的離心管中,4℃,8200×g離心10分鐘;
4) 吸取上清至新的離心管中,4℃,16000×g離心10分鐘;
5) 小心吸取上清至新的離心管中(1.5ml離心管,每管不超過1ml), -80℃保存;
6)干冰寄送樣本。
提示:建議送樣量5 mL 以上(大致需全血8-10mL)
血漿
注意:收集血漿樣本用于RNA研究時一定不要用肝素抗凝管。
1) 采集外周血(建議早晨空腹抽血),迅速轉入EDTA抗凝管中,渦旋或顛倒混合5~10 次;
2) 在1小時(室溫)或2小時(4℃)內進行血漿分離,8200×g離心10分鐘;
3) 吸取上清至新的離心管中,4℃,16000×g離心10分鐘;
4) 小心吸取上清至新的離心管中(1.5ml離心管,每管不超過1ml),-80℃保存;
5)干冰寄送樣本。
提示:建議送樣量5 mL以上(大致需全血8-10mL)
Tips: 血液樣本外泌體研究血清好還是血漿好?
血漿=血液-血細胞;血清=血漿-纖維蛋白原-凝血因子;血清是血液凝固之后收集的液體,在凝血過程中血小板會分泌大量的外泌體,有研究發(fā)現(xiàn)血清中有接近50%的外泌體來自額外的分泌,所以一般實驗會選擇血漿。在特殊情況下,如研究與血小板相關疾病的時候,血清比血漿更適合。此外,在采血后最好盡快處理樣本,因血液收集到收集管后,血細胞和血小板會繼續(xù)分泌外泌體
細胞上清
注意:細胞培養(yǎng)基必須使用去除外泌體的血清或者無血清培養(yǎng)基
1) 正常含有血清的培養(yǎng)基中培養(yǎng)細胞24h左右,貼壁細胞密度達到70%~80%,懸浮細胞密度達到60%~70%;
2) 將原有血清培養(yǎng)基更換為去除外泌體的血清或者無血清培養(yǎng)基(貼壁細胞直接去除原有培養(yǎng)基,加入適量PBS緩沖液沖洗一次,更換新的培養(yǎng)基;懸浮細胞4℃,300×g離心10分鐘,收集細胞后,加入適量PBS緩沖液沖洗一次,更換新的培養(yǎng)基)繼續(xù)培養(yǎng);
3) 培養(yǎng)48-72小時后,根據(jù)細胞數(shù)量確定收取上清時間;
4) 4℃,300×g,離心10分鐘收集細胞上清;
5) 4℃,3000×g,離心15分鐘,確保將細胞及細胞碎片去除干凈;
6) 吸取上清,-80℃保存;
7)干冰寄送樣本。
提示:送樣量最好在50 mL 以上,不少于30ml
尿液
1) 收集清晨第一次尿液50ml,注意避免細菌污染,收集前注意飲食控制,前一晚22:00后禁食禁水;
2) 4 ℃ ,3000×g,離心15分鐘,去除細胞或細胞碎片;
3) 收集上清尿液分裝轉移至15ml離心管中,-80℃保存;
4)干冰寄送樣本。
提示:送樣量最好在50 mL 以上
腦脊液
1) 收集腦脊液,收集過程中避免血液污染;
2) 3000×g,離心15分鐘,去除細胞或細胞碎片;
3) 收集上清,-80℃冰箱中保存;
4)干冰寄送樣本。
提示:送樣量最好在20 mL 以上
注:以上建議的送樣量綜合考慮了外泌體的表征檢測(TEM、NTA、WB)和組學研究(轉錄組、蛋白質組)的樣本需求量。上述細胞上清送樣量主要指常規(guī)腫瘤細胞,對于其他類型細胞,最好在送樣前進行預實驗,以確定外泌體含量。
目前外泌體的分離方法中應用廣泛的是超速離心法和試劑盒抽提法,超速離心法是外泌體分離的金標準,是高分文章常用的分離方法,獲得的外泌體純度高。其原理主要是依據(jù)外泌體與其他微小囊泡密度和大小的不同而分離,通過逐步提高離心速度,有效去除細胞、細胞碎片和大囊泡,收集高純度的外泌體。外泌體抽提試劑盒分離外泌體省時省力,外泌體純度高,SBI外泌體抽提試劑盒,樣本需求量少,最少可從100ul血清或5ml細胞上清中分離外泌體。利用超離或試劑盒法分離獲得的外泌體,經(jīng)表征檢測確定后即可進行后續(xù)的組學研究。
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